De su obra literaria destacan dos novelas:El hombre que no sabía pecar,publicada con el pseudónimo de Martín Azcárate y La frontera de Dios, así como los ensayos Un cura se confiesa, Siempre es Viernes Santo y Vida y Misterios de Jesús de Nazaret. Muy conocido como periodista, sus famosos artículos Razones para... han sido publicados pótumamente en varios volúmenes.

La creación poética constituyó siempre para Martín Descalzo la forma esencial de comunicar, no sólo sus sentimientos más hondos, sino su pensamiento y su fe. Resaltamos Fábulas con Dios al fondo, Camino de la cruz, Querido mundo terrible, Testamento del pájaro solitario, el último e impresionante poemario del autor y la magnífica antología de poemas de Charles Péguy traducida por Martín Descalzo con el título Palabras Cristianas.

José Luis Martín Descalzo, tras una larga enfermedad renal, murió en Madrid el martes 11 de junio de 1991.